ابراهیم رئیسی، عضو مجمع تشخیص مصلحت نظام و تولیت آستان قدس رضوی در دانشگاه شهید بهشتی تهران در پاسخ به سؤالی درباره اعدام‌های سال ۶۷ گفت: «در سال ۶۷ پرونده افرادی از منافقین [مجاهدین خلق ایران] مورد رسیدگی قرار گرفته بود و دادگاه حکم داده بود و دیوان عالی کشور نیز تایید کرده بود، ولی فوراً نیاز نبود که حکم‌شان اجرا شود (…) امام خمینی گفتند آنها که حکمشان تایید شده ولی به اجرای آن به دلایلی به تاخیر افتاده، هیأت‌هایی بنشینند و بررسی کنند که آیا شرایط اجرای حکم وجود دارد یا نه؟ من هیچکدام از آن سه سمت تصریح شده را در حکم امام نداشتم. افتخار من آن است که با جریان نفاق، فساد و چپاول مبارزه کرده‌ام، اما تعجب نسبت به کسانی است که مدعی حقوقدانی هستند، اما بین دادستانی و قاضی فرقی نمی‌گذارند‌.» روزنامه قانون با درج این خبر به نقل از خبرگزاری فارس – از خبرگزاری‌های نزدیک به سپاه – می‌نویسد این توضیحات «ابتدایی‌ترین سخنان این فرد درباره سال ۶۷ است.» در اعدام‌های ۶۷ بین سه تا نزدیک به پنج هزار نفر از زندانیان عقیدتی و سیاسی اعدام و در گورهای دسته‌جمعی به خاک سپرده شدند. سید موسوی تبریزی تأیید کرده که ابراهیم رئیسی در صدور حکم اعدام زندانیان عقیدتی – سیاسی در تابستان دست داشته است. دادستان کل انقلاب اسلامی در دوران زمامداری خمینی گفته است: «این مسلم است که آقای رییسی جزو آن دسته افرادی بودند که حکم درباره زندانی‌های سال ۶۷ به او ابلاغ شده بود. رییسی بعد از آقای لاجوردی جانشین دادستان انقلاب تهران بود و این موضوع را از خود آقای رییسی باید بپرسید.»